水产养殖学专业于2012年开始招生，至今已招收12届本科生。本专业依托湖州作为全国著名的淡水鱼重点产区、“两山”理念诞生地、美丽乡村发源地以及“生态+”绿色发展先行地等独特的区位和产业优势，目前该专业为浙江省一流专业建设点和浙江省新兴特色专业，拥有水产一级学科硕士学位点。在2023年，本专业跻身校友会2023中国大学水产养殖学专业排名（研究型）前10名（4★，B++） 。
该专业现有教师29人，正高职称12人，副高职称11人，博士24人。教师队伍中拥有共享院士1人，国家级领军人才1人，国家现代农业产业技术体系岗位科学家5人（包括原岗位科学家3人），全国水产学科首席科学传播专家1人，国家原良种审定委员会委员1人，省突出贡献中青年专家1人，省“151人才工程” 第二层次1人，第三层次3人，省高校中青年学科带头人2人。师资成员年龄结构合理、知识结构互补、创新能力强，是一支充满活力的教师队伍。
近五来专任教师新增国家级项目9项，省部级项目24项（包括省重点研发项目7项），横向项目95项。主持获浙江省科技进步一等奖1项，浙江省自然科学一等奖1项，中国商业联合会科学技术奖一等奖2项、二等奖1项，参与获上海市科技进步二等奖1项；获罗氏沼虾“数丰1号”新品种。助力湖州在全国率先实施水产养殖尾水全域治理，“浙江湖州桑基鱼塘系统”获批“全球重要农业文化遗产（GIAHS）”。在国内外权威刊物上发表专业学术论文200余篇，其中 SCI、EI 等检索论文140多篇，已授权发明专利13项。承担教育部产学合作协同育人项目1项，省部级教学教改项目3项，获本科课堂教学质量奖、课程思政优秀教学说课奖多项。通过科研反哺教学，近几年学生在实践教学、创新创业方面成果显著，教师指导学生竞赛和实践活动获省级以上奖励 30余项，获国家创新创业项目25项，指导本科生第一作者发表论文10余篇。
本专业所在学科系“十二五”省重点学科、“十三五”省一流学科，拥有浙江-法国水域资源与环境数字化监控联合实验室、水生生物与环境研究国际联合实验室（HU-UQAR Joint International Research Laboratory of Aquaculture and Environments）、水生动物繁育与营养国家地方联合工程实验室、国家水产种质资源平台南太湖保存基地、浙江省淡水养殖重点科技创新团队、浙江省教学示范中心、浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室、浙江省院士专家工作站、中国水产科学研究院水生动物繁殖营养重点实验室、浙江省渔业科技创新服务平台水生生物学与水环境研发中心、水生动物育种与健康管理研究所（与中国水产科学研究院共建）以及与中国科学院水生生物研究所、湖州市人民政府共建的水生生物资源养护与开发创新中心与南太湖水生生物生态与环境野外观测研究站等。实验室总面积3500多平方米，仪器设备及试验设施资产总值3000多万元。
专业主干课程有生物化学、细胞生物学（含实验）、养殖水环境化学（含实验）、水产动物营养与饲料学（含实验）、池塘养殖学、水产动物病害学（含实验）等。
本专业通过以“绿色”水域环境调控与修复、“绿色”水产苗种繁育、“绿色”水产饲料研发、“绿色”防控与管理等为核心内容的课程体系和“四年一贯制”实践教学体系，培养 “宽口径、厚基础、懂技术、会管理、强能力、高素质”的 “绿色渔业”复合型水产专业人才。该专业连续四届毕业生就业率100%，毕业生主要在水产养殖生产、教育、科研和管理等部门从事科学研究、教学、水产养殖开发及渔业管理等工作，同时该专业考研成功率高，其中2017届毕业生考研报考录取率81.25%，居全校首位。（更新于2024年3月）
