邵朝纲

发布者:站群模板发布时间:2022-09-06浏览次数:1583

一、个人简介

   邵朝纲,男,1976年生,浙江安吉人,博士,教授,生科院教学副院长。

二、学习和工作经历

1 1995.9-1999.6, 浙江大学(玉泉校区), 生物科学与技术系, 本科, 浙江大学优秀毕业生;

21999.7-2004.8, 中科院上海生命科学院, 生化与分子生物学, 理学博士;

3 2004.8-至今,湖州师范学院生命科学院, 讲师、副教授、教授;

4 2010年进入浙江大学(陈铭教授)研究组进修生物信息学。

三、主讲课程

    《分子生物学与基因工程》

四、教学荣誉

1邵朝纲. 湖州师范学院求真学院“我最喜爱的老师”,2008年。

2邵朝纲. 浙江省第二届大学生生命科学竞赛,二等奖,指导教师,2010年。

3邵朝纲.《克隆助手1.0. 浙江省高校教师教学软件比赛,三等奖2010 排名:1/4

4邵朝纲. 克隆助手2.0. 湖州师范学院青年教师多媒体软件制作竞赛,二等奖,2011年,排名:1/3

5邵朝纲.基因工程”教学辅助软件的开发和应用,湖州师范学院教学成果,二等奖, 2012年。

6】邵朝纲. 基于提高学生综合能力的“五个兼顾、多维结合、全程评价”遗传学教学模式. 湖州师范学院教学成果,一等奖, 2012年,排名:2/4

7】邵朝纲. 全国第三届“共享杯”大学生科技资源共享服务创新大赛,优胜奖,指导教师,2015年。

8】邵朝纲. 《生物信息学(第三版)》副主编,普通高等教育“十三五”规划教材,科学出版社,2018年。

 

五、学术研究方向

    1 生物信息学软件的开发;

     2 模式植物非编码RNA的数据挖掘。

六、主持省级以上项目

1邵朝纲. 基于逆向挖掘技术获取水稻和拟南芥新的miRNAs-靶基因调控网络. 国家自然科学基金面上项目(编号31271380),2013-2016

2邵朝纲. ta-siRNA异常合成机制的研究及其调控网络的重构。国家自然科学基金面上项目(编号31771457),2018-2021

3邵朝纲.基于全新挖掘算法的疾病相关miRNA新基因的大规模挖掘.浙江省公益性技术应用研究计划项目(编号2016C33193), 2016-2019

4邵朝纲.基于前体加工切割信号的miRNA大规模挖掘新算法的研究.浙江省自然科学基金(编号LY15C060004), 2015-2017

七、代表性论文

1Chaogang Shao, Yijun Meng, Shaolei Lv, Wei Zhong, Zheyu Wang, Ming Chen. CloneAssistant 1.0: A stand-alone software for automated cloning primer design, Journal of Biotechnology, 2010,150(3):294~298 (IF=2.667)

2Yijun Meng#, Chaogang Shao#, Lingfeng Gou, Yongfeng Jin, Ming chen. Construction ofmicroRNA- and microRNA*-mediated regulatory networks in plants, RNA Biology, 2011,8(6):1~25 ( # Co-first author, IF=4.076)

3 Chaogang Shao, Xiaoxia Ma, Xiufang Xu, Huizhong Wang, Yijun Meng. Genome-wide identification of reverse complementary microRNA genes in plants. PLoS ONE, 2012,710):e46991. (IF=2.74)

4 Chaogang Shao, Ming Chen, Yijun Meng. A reverse framework for the identification of microRNA—target pairs in plants. Briefings in Bioinformatics, 2013;14(3):293-301  (IF=8.399)

5Chaogang Shao, Xiaoxia Ma, Xiufang Xu, Yijun Meng. Identification of the highly accumulated microRNA*s in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) and rice (Oryza sativa). Gene, 2013,515:123–127  (IF=2.319)

6Chaogang Shao, Qianer Wu, Jinjin Qiu, Shaohua Jin, Beilun Zhang, Jian Qian, Ming Chen,Yijun Meng. Identification of novel microRNA-like-coding sites on the long-stem microRNA precursors of Arabidopsis. Gene, 2013,527:477–483 (IF=2.319)

7Chaogang Shao, Ai-wen Dong, Xiaoxia Ma,Yijun Meng. Is Argonaute 1 the only effective slicer of small RNA-mediated regulation of gene expression in plants? Journal of Experimental Botany, 2014, 65(22):6293-6299 ( IF = 5.677)

8 Chaogang Shao, et al.  SNP or RNA editing? J. Plant Biochem. Biotechnol, 2014, 23(2), 123-124. (IF =1.352)

9 Lan Yu, Yijun Meng*, Chaogang Shao*, Kahrizi D. Are ta-siRNAs only originated from the cleavage site of miRNA on its target RNAs and phased in 21-nt increments? Gene, 2015, 569(1):127~135  (* corresponding author, IF=2.319)

10Lan Yu#, Chaogang Shao#,  Xinghuo Ye,Yijun Meng, Yincong Zhou, Ming Chen. miRNA Digger, a comprehensive pipeline for genomic-wide novel miRNA mining. Scientific Reports, 2016, 6:18901, (# Co-first author, IF=5.228 )

11 Lan Yu, Rongkai Guo,Yeqin Jiang, Xinghuo Ye, Zhihong Yang,Yijun Meng, Chaogang Shao*. Identification of novel phasiRNAs loci on long non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana. Genomics, 2019, 111 1668–1675  (* corresponding authorIF= 6.205)

12 Lan Yu, Rongkai Guo, Yeqin Jiang, Xinghuo Ye, Zhihong Yang, Yijun Meng & Chaogang Shao*.Genome-wide identification and characterization of novel microRNAs in seed development of soybean. BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND BIOCHEMISTRY. 2019, 83:2, 233-242. (* corresponding authorIF=1.516)

13Xinghuo Ye#, Yeqin Jiang#, Lan Yu, Zhihong Yang, Yijun Meng & Chaogang Shao*. Identification of novel microRNAs in rice (Oryza sativa) based on the cleavage signals in precursors. Plant Biosystems. 2019, 1534, 506–513 (* corresponding authorIF=1.787)

14 Xinghuo Ye#, Zhihong Yang#, Yeqin Jiang, Lan Yu, Rongkai Guo, Yijun Meng, Chaogang Shao*. sRNATargetDigger: A bioinformatics software for bidirectional identification of sRNA-target pairs with co-regulatory sRNAs information. PLOS ONE 202015(12): e0244480. (* corresponding authorIF=2.74)

15Lan Yu, RongkaiGuo, Yeqin Jiang, XinghuoYe, Zhihong Yang, Yijun Meng, Chaogang Shao*. Degradome sequencing-based identification of phasiRNAs biogenesis pathways in Oryza sativa. BMC Genomics, 2021, 22:93. (* corresponding authorIF=3.501)

八、学术荣誉

1邵朝纲. 《快速鉴定新城疫病毒毒力方法的研究》.国家质检总局科技兴检奖 二等奖2002, 排名4/8

2邵朝纲. 《异源表达RRSV刺突蛋白的转基因水稻抑制病毒的媒传》. 第十三届浙江省优秀自然科学论文二等奖2005,排名1/3

3邵朝纲. 1112人才工程”学术技术带头人培养人选, 2013年。

4邵朝纲. 湖州市第四届青年科技奖, 2013年。

5邵朝纲.《一种用于挖掘植物中microRNA-靶基因对的逆向流程》,湖州市第五届优秀自然科学论文,一等奖,2014年,排名1/3

6邵朝纲. 《基于高通量数据的植物非编码转录组生物信息学研究》,浙江省自然科学奖,三等奖(浙江省人民政府,编号:2015-Z-3-007-R03)2015年, 排名3/4

7邵朝纲. “南太湖特支计划”科技创新领军人才,2019年。

九、学术兼职

    浙江省生物信息学会副理事长,BioinformaticsBriefings in BioinformaticsOncogenesisPlant Physiology and BiochemistryGeneBioMed Research InternationalJournal of Plant PhysiologyPlant Cell Reports等期刊的特邀审稿人。