一、个人简介
邵朝纲,男,1976年生,浙江安吉人,博士,教授,生科院教学副院长。
二、学习和工作经历
【1】 1995.9-1999.6, 浙江大学(玉泉校区), 生物科学与技术系, 本科, 浙江大学优秀毕业生;
【2】1999.7-2004.8, 中科院上海生命科学院, 生化与分子生物学, 理学博士;
【3】 2004.8-至今,湖州师范学院生命科学院, 讲师、副教授、教授;
【4】 2010年进入浙江大学(陈铭教授)研究组进修生物信息学。
三、主讲课程
《分子生物学与基因工程》
四、教学荣誉
【1】邵朝纲. 湖州师范学院求真学院“我最喜爱的老师”,2008年。
【2】邵朝纲. 浙江省第二届大学生生命科学竞赛,二等奖,指导教师,2010年。
【3】邵朝纲.《克隆助手1.0》. 浙江省高校教师教学软件比赛,三等奖,2010年, 排名:1/4。
【4】邵朝纲. “克隆助手2.0”. 湖州师范学院青年教师多媒体软件制作竞赛,二等奖,2011年,排名:1/3。
【5】邵朝纲.“基因工程”教学辅助软件的开发和应用,湖州师范学院教学成果,二等奖, 2012年。
【6】邵朝纲. 基于提高学生综合能力的“五个兼顾、多维结合、全程评价”遗传学教学模式. 湖州师范学院教学成果,一等奖, 2012年,排名:2/4。
【7】邵朝纲. 全国第三届“共享杯”大学生科技资源共享服务创新大赛,优胜奖,指导教师,2015年。
【8】邵朝纲. 《生物信息学(第三版)》副主编,普通高等教育“十三五”规划教材,科学出版社,2018年。
五、学术研究方向
【1】 生物信息学软件的开发;
【2】 模式植物非编码RNA的数据挖掘。
六、主持省级以上项目
【1】邵朝纲. 基于逆向挖掘技术获取水稻和拟南芥新的miRNAs-靶基因调控网络. 国家自然科学基金面上项目(编号31271380),2013-2016
【2】邵朝纲. ta-siRNA异常合成机制的研究及其调控网络的重构。国家自然科学基金面上项目(编号31771457),2018-2021
【3】邵朝纲.基于全新挖掘算法的疾病相关miRNA新基因的大规模挖掘.浙江省公益性技术应用研究计划项目(编号2016C33193), 2016-2019
【4】邵朝纲.基于前体加工切割信号的miRNA大规模挖掘新算法的研究.浙江省自然科学基金(编号LY15C060004), 2015-2017
七、代表性论文
【1】Chaogang Shao, Yijun Meng, Shaolei Lv, Wei Zhong, Zheyu Wang, Ming Chen. CloneAssistant 1.0: A stand-alone software for automated cloning primer design, Journal of Biotechnology, 2010,150(3):294~298 (IF=2.667)
【2】Yijun Meng#, Chaogang Shao#, Lingfeng Gou, Yongfeng Jin, Ming chen. Construction ofmicroRNA- and microRNA*-mediated regulatory networks in plants, RNA Biology, 2011,8(6):1~25 ( # Co-first author, IF=4.076)
【3】 Chaogang Shao, Xiaoxia Ma, Xiufang Xu, Huizhong Wang, Yijun Meng. Genome-wide identification of reverse complementary microRNA genes in plants. PLoS ONE, 2012,7(10):e46991. (IF=2.74)
【4】 Chaogang Shao, Ming Chen, Yijun Meng. A reverse framework for the identification of microRNA—target pairs in plants. Briefings in Bioinformatics, 2013;14(3):293-301 (IF=8.399)
【5】Chaogang Shao, Xiaoxia Ma, Xiufang Xu, Yijun Meng. Identification of the highly accumulated microRNA*s in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) and rice (Oryza sativa). Gene, 2013,515:123–127 (IF=2.319)
【6】Chaogang Shao, Qianer Wu, Jinjin Qiu, Shaohua Jin, Beilun Zhang, Jian Qian, Ming Chen,Yijun Meng. Identification of novel microRNA-like-coding sites on the long-stem microRNA precursors of Arabidopsis. Gene, 2013,527:477–483 (IF=2.319)
【7】Chaogang Shao, Ai-wen Dong, Xiaoxia Ma,Yijun Meng. Is Argonaute 1 the only effective slicer of small RNA-mediated regulation of gene expression in plants? Journal of Experimental Botany, 2014, 65(22):6293-6299 ( IF = 5.677)
【8】 Chaogang Shao, et al. SNP or RNA editing? J. Plant Biochem. Biotechnol, 2014, 23(2), 123-124. (IF =1.352)
【9】 Lan Yu, Yijun Meng*, Chaogang Shao*, Kahrizi D. Are ta-siRNAs only originated from the cleavage site of miRNA on its target RNAs and phased in 21-nt increments? Gene, 2015, 569(1):127~135 (* corresponding author, IF=2.319)
【10】Lan Yu#, Chaogang Shao#, Xinghuo Ye,Yijun Meng, Yincong Zhou, Ming Chen. miRNA Digger, a comprehensive pipeline for genomic-wide novel miRNA mining. Scientific Reports, 2016, 6:18901, (# Co-first author, IF=5.228 )
【11】 Lan Yu, Rongkai Guo,Yeqin Jiang, Xinghuo Ye, Zhihong Yang,Yijun Meng, Chaogang Shao*. Identification of novel phasiRNAs loci on long non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana. Genomics, 2019, 111 :1668–1675 (* corresponding author,IF= 6.205)
【12】 Lan Yu, Rongkai Guo, Yeqin Jiang, Xinghuo Ye, Zhihong Yang, Yijun Meng & Chaogang Shao*.Genome-wide identification and characterization of novel microRNAs in seed development of soybean. BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND BIOCHEMISTRY. 2019, 83:2, 233-242. (* corresponding author,IF=1.516)
【13】Xinghuo Ye#, Yeqin Jiang#, Lan Yu, Zhihong Yang, Yijun Meng & Chaogang Shao*. Identification of novel microRNAs in rice (Oryza sativa) based on the cleavage signals in precursors. Plant Biosystems. 2019, 153(4), 506–513 (* corresponding author,IF=1.787)
【14】 Xinghuo Ye#, Zhihong Yang#, Yeqin Jiang, Lan Yu, Rongkai Guo, Yijun Meng, Chaogang Shao*. sRNATargetDigger: A bioinformatics software for bidirectional identification of sRNA-target pairs with co-regulatory sRNAs information. PLOS ONE ,2020,15(12): e0244480. (* corresponding author,IF=2.74)
【15】Lan Yu, RongkaiGuo, Yeqin Jiang, XinghuoYe, Zhihong Yang, Yijun Meng, Chaogang Shao*. Degradome sequencing-based identification of phasiRNAs biogenesis pathways in Oryza sativa. BMC Genomics, 2021, 22:93. (* corresponding author,IF=3.501)
八、学术荣誉
【1】邵朝纲. 《快速鉴定新城疫病毒毒力方法的研究》.国家质检总局“科技兴检奖”, 二等奖,2002年, 排名4/8。
【2】 邵朝纲. 《异源表达RRSV刺突蛋白的转基因水稻抑制病毒的媒传》. 第十三届浙江省优秀自然科学论文,二等奖,2005年,排名1/3。
【3】邵朝纲. “1112人才工程”学术技术带头人培养人选, 2013年。
【4】邵朝纲. 湖州市第四届青年科技奖, 2013年。
【5】邵朝纲.《一种用于挖掘植物中microRNA-靶基因对的逆向流程》,湖州市第五届优秀自然科学论文,一等奖,2014年,排名1/3。
【6】邵朝纲. 《基于高通量数据的植物非编码转录组生物信息学研究》,浙江省自然科学奖,三等奖(浙江省人民政府,编号:2015-Z-3-007-R03),2015年, 排名3/4。
【7】邵朝纲. “南太湖特支计划”科技创新领军人才,2019年。
九、学术兼职
浙江省生物信息学会副理事长,Bioinformatics,Briefings in Bioinformatics,Oncogenesis,Plant Physiology and Biochemistry,Gene,BioMed Research International,Journal of Plant Physiology,Plant Cell Reports等期刊的特邀审稿人。